Help for package LeLogicielR

Type:

Package

Title:

Companion to the Book Le Logiciel R

Version:

1.2.3

Date:

2026-08-05

Description:

Functions and datasets for readers of the book "Le logiciel R: Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques" by Lafaye de Micheaux, Drouilhet and Liquet (2011) <doi:10.1007/978-2-8178-0115-5>. The documentation and help pages are written in French.

Language:

License:

GPL-2 | GPL-3 [expanded from: GPL (≥ 2)]

LazyLoad:

yes

Depends:

xtable, RColorBrewer, gdata, IndependenceTests

Encoding:

UTF-8

NeedsCompilation:

yes

Packaged:

2026-08-05 13:07:26 UTC; lafaye

Author:

Pierre Lafaye De Micheaux [aut, cre], Remy Drouilhet [aut], Benoit Liquet [aut]

Maintainer:

Pierre Lafaye De Micheaux <lafaye@unsw.edu.au>

Repository:

CRAN

Date/Publication:

2026-08-23 10:50:02 UTC

Indice de masse corporelle chez les enfants

Description

Ce jeu de donnÃ©es provient d'une Ã©tude Ã©pidÃ©miologique traitÃ©e par une Ã©quipe de l'Institut de santÃ© publique d'Ã©pidÃ©miologie et de dÃ©veloppement (ISPED) de Bordeaux. Un Ã©chantillon de dossiers d'enfants a Ã©tÃ© saisi. Ce sont des enfants vus lors d'une visite en 1Ã¨re section de maternelle en 1996-1997 dans des Ã©coles de Bordeaux (Gironde, France). L'Ã©chantillon est constituÃ© de 152 enfants Ã¢gÃ©s de 3 ou 4 ans.

Usage

data(IMC.ENFANT)

Format

Un data frame avec 152 observations mesurÃ©es sur les 6 variables suivantes.

SEXE: un facteur ayant les niveaux F et G
zep: un facteur ayant les niveaux N et O
poids: un vecteur numÃ©rique
an: un vecteur numÃ©rique
mois: un vecteur numÃ©rique
taille: un vecteur numÃ©rique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

Source

https://www.biostatisticien.eu/springeR/

Examples

data(IMC.ENFANT)
str(IMC.ENFANT)

Etude sur l'infarctus du myocarde

Description

Usage

data(INFARCTUS)

Format

Un data frame avec 449 observations mesurÃ©es sur les 10 variables suivantes.

NUMERO: un vecteur numÃ©rique
INFARCT: un vecteur numÃ©rique
CO: un vecteur numÃ©rique
TABAC: un vecteur numÃ©rique
AGE: un vecteur numÃ©rique
POIDS: un vecteur numÃ©rique
TAILLE: un vecteur numÃ©rique
IMC: un vecteur numÃ©rique
ATCD: un vecteur numÃ©rique
HTA: un vecteur numÃ©rique

Details

Les donnÃ©es suivantes sont issues d'une enquÃªte cas-tÃ©moins dont le but Ã©tait d'Ã©valuer l'existence d'un risque plus Ã©levÃ© de survenue d'un infarctus du myocarde chez les femmes qui utilisent ou ont utilisÃ© des contraceptifs oraux. L'Ã©tude a Ã©tÃ© menÃ©e auprÃ¨s de 149 femmes ayant eu un infarctus du myocarde (cas) et 300 femmes n'en n'ayant pas eu (tÃ©moins).

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

Source

https://www.biostatisticien.eu/springeR/

Examples

data(INFARCTUS)
str(INFARCTUS)

Epaisseur de l'intima-media

Description

Ce jeu de donnÃ©es provient d'une Ã©tude Ã©pidÃ©miologique traitÃ©e par une Ã©quipe de l'Institut de santÃ© publique d'Ã©pidÃ©miologie et de dÃ©veloppement (ISPED) de Bordeaux. L'Ã©paisseur de l'intima-mÃ©dia est un marqueur reconnu d'athÃ©rosclÃ©rose. Elle a Ã©tÃ© mesurÃ©e par Ã©chographie sur un Ã©chantillon de 110 sujets en 1999 dans les CHU de Bordeaux. Des informations sur les principaux facteurs de risque ont aussi Ã©tÃ© recueillies.

Usage

data(INTIMA.MEDIA)

Format

Un data frame avec 110 observations mesurÃ©es sur les 9 variables suivantes.

SEXE: un vecteur numÃ©rique
AGE: un vecteur numÃ©rique
taille: un vecteur numÃ©rique
poids: un vecteur numÃ©rique
tabac: un vecteur numÃ©rique
paqan: un vecteur numÃ©rique
SPORT: un vecteur numÃ©rique
mesure: un vecteur numÃ©rique
alcool: un vecteur numÃ©rique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

Source

https://www.biostatisticien.eu/springeR/

Examples

data(INTIMA.MEDIA)
str(INTIMA.MEDIA)

Package illustrant le livre: Le Logiciel R

Description

Ce package permet d'utiliser certaines fonctions contruites Ã l'occasion de l'Ã©criture du livre :Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques. Vous pouvez aussi y trouver les jeux de donnÃ©es utilisÃ©es dans ce livre.

Details

Package:	LeLogicielR
Type:	Package
Version:	0.5
Date:	2010-10-09
License:	GPL(>=2.0)
LazyLoad:	yes

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Alimentation chez des personnes agees

Description

Ce jeu de donnÃ©es provient d'une Ã©tude Ã©pidÃ©miologique traitÃ©e par une Ã©quipe de l'Institut de santÃ© publique d'Ã©pidÃ©miologie et de dÃ©veloppement (ISPED) de Bordeaux. Un Ã©chantillon de personnes Ã¢gÃ©es rÃ©sidant Ã Bordeaux (Gironde, France) a Ã©tÃ© interrogÃ© en 2000 dans le cadre d'une enquÃªte nutritionnelle. L'Ã©chantillon est constituÃ© de 226 sujets.

Usage

data(NUTRIAGE)

Format

Un data frame avec 226 observations mesurÃ©es sur les 13 variables suivantes.

sexe: un vecteur numÃ©rique
situation: un vecteur numÃ©rique
the: un vecteur numÃ©rique
cafe: un vecteur numÃ©rique
taille: un vecteur numÃ©rique
poids: un vecteur numÃ©rique
age: un vecteur numÃ©rique
viande: un vecteur numÃ©rique
poisson: un vecteur numÃ©rique
fruit_crus: un vecteur numÃ©rique
fruit_legume_cuits: un vecteur numÃ©rique
chocol: un vecteur numÃ©rique
matgras: un vecteur numÃ©rique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

Source

https://www.biostatisticien.eu/springeR/

Examples

data(NUTRIAGE)
str(NUTRIAGE)

Poids de naissance

Description

Ce jeu de donnÃ©es provient d'une Ã©tude Ã©pidÃ©miologique traitÃ©e par une Ã©quipe de l'Institut de santÃ© publique d'Ã©pidÃ©miologie et de dÃ©veloppement (ISPED) de Bordeaux. Il s'agit d'une enquÃªte concernant les facteurs de risque associÃ©s au faible poids de naissance de nourrissons (donnÃ©es collectÃ©es au centre mÃ©dical de Baystate dans le Massachusetts pendant l'annÃ©e 1986).

Usage

data(POIDS.NAISSANCE)

Format

Un data frame avec 189 observations mesurÃ©es sur les 11 variables suivantes.

ID: un vecteur numÃ©rique
AGE: un vecteur numÃ©rique
LWT: un vecteur numÃ©rique
RACE: un vecteur numÃ©rique
SMOKE: un vecteur numÃ©rique
PTL: un vecteur numÃ©rique
HT: un vecteur numÃ©rique
UI: un vecteur numÃ©rique
FVT: un vecteur numÃ©rique
BWT: un vecteur numÃ©rique
LOW: un vecteur numÃ©rique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

Source

https://www.biostatisticien.eu/springeR/

Examples

data(POIDS.NAISSANCE)
str(POIDS.NAISSANCE)

Address of vector

Description

Object representing an address of numeric vector

Usage

VectorAddr(x)

Arguments

x

Vector.

Value

An object of class VectorAddr.

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <b.liquet@uq.edu.au>

References

Chapter 9 (Managing Sessions) from the book: The R Software, Fundamentals of Programming and Statistical Analysis

Examples


x <- c(8L,9L)
addr <- VectorAddr(x)		# Gets the address of the first
                            # box of the 64-box block where x
                            # is stored.
addr
update(addr,6L) # Write the integer 6 at this address.
x
update(addr+4L,7L) # An integer is coded over 4 bytes,
                      # hence increment the address by 4 to
                      # get to x[2].
x
x <- c(12.8,4.5)
x
addr <- VectorAddr(x)		# Get the address of the first box
                            # of the 128-box block where x is
                            # stored.
update(addr,6.2)
x
update(addr+8L,7.1) # A double is coded over 8 bytes.
x

Diagramme circulaire

Description

Cette fonction offre une variante de la fonction pie

Usage

camembert(x, col = NULL, cex = 0.7, family = "sans", family.main = "HersheyScript",
          main = NULL, col.main = "black", cex.main = 0.5)

Arguments

x

variable qualitative

col

un vecteur de chaine de caractÃ¨res pour la couleur de chaque modalitÃ©

cex

taille des caractÃ¨res pour le graphique

family

famille de polices pour les Ã©lÃ©ments sur le camembert. Par dÃ©faut, la police utilisÃ©e est "sans".

family.main

famille de polices pour le titre. Par dÃ©faut, la police utilisÃ©e est "HersheyScript".

main

titre

col.main

couleur du titre

cex.main

taille des caractÃ¨res pour le titre

Value

Un graphique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 9 (Statistique descriptive) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(NUTRIAGE)
attach(NUTRIAGE)
matgras <- as.factor(matgras)
levels(matgras) <- c("beurre","margarine","arachide","tournesol","olive","Isio4","colza","canard")
require("RColorBrewer")
col <- brewer.pal(8,"Pastel2")
camembert(matgras,col)
detach(NUTRIAGE)

Test du coefficient de correlation

Description

Test du coefficient de corrÃ©lation entre deux variables quantitatives

Usage

cor0.test(x, y, rho0 = 0, alternative = c("two.sided", "less", "greater"))

Arguments

x

un vecteur numÃ©rique

y

est un vecteur numÃ©rique

rho0

rÃ©el indiquant la valeur du coefficient de corrÃ©lation pour l'hypothÃ¨se nulle. Par dÃ©faut rho0 vaut 0

alternative

HypothÃ¨se alternative du test. Trois tests sont possibles: bilatÃ©ral ("two.sided"), unilatÃ©ral infÃ©rieur ("less"), unilatÃ©ral supÃ©rieur ("greater"). Par dÃ©faut c'est l'hypothÃ¨se "two.sided".

Value

Retourne une liste :

statistic

La valeur de la statistique de test

p.value

La valeur-p du test

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 11 (Intervalles de confiance et tests d'hypothÃ¨ses) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(IMC.ENFANT)
attach(IMC.ENFANT)
cor0.test(poids,taille)
detach(IMC.ENFANT)

Comparaison de deux coefficients de correlation

Description

Test de l'Ã©galitÃ© de deux coefficients de corrÃ©lation

Usage

cor2.test.2.sample(x1, y1, x2, y2, alternative = c("two.sided", "less", "greater"))

Arguments

x1

x1 vecteur numÃ©rique associÃ© Ã y1

y1

y1 vecteur numÃ©rique associÃ© Ã x1

x2

x2 vecteur numÃ©rique associÃ© Ã y2

y2

y2 vecteur numÃ©rique associÃ© Ã x2

alternative

Value

Retourne une liste contenant

statistic

La valeur de la statistique de test

p.value

La valeur-p du test

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 11 (Intervalles de confiance et tests d'hypothÃ¨ses) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(IMC.ENFANT)
attach(IMC.ENFANT)
indf <- which(SEXE=="F")  # Permet de recuperer les indices des filles.
indg <- which(SEXE=="G")  # Permet de recuperer les indices des garcons.
cor2.test.2.sample(taille[indf],poids[indf],taille[indg],poids[indg])
detach(IMC.ENFANT)

Diagramme en croix

Description

Le diagramme en croix affiche pour chaque observation une petite croix au-dessus de la modalitÃ© correspondante

Usage

diagcroix(x, titre, col, family = "HersheyScript")

Arguments

x

variable qualitative

titre

chaine de caractÃ¨res pour le titre du graphique

col

vecteur de chaines de caractÃ¨res pour la couleur de chaque modalitÃ©

family

famille de polices pour le titre. Par dÃ©faut, la police utilisÃ©e est "HersheyScript".

Value

Un graphique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 9 (Statistique descriptive) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(NUTRIAGE)
attach(NUTRIAGE)
situation <- as.factor(situation)
levels(situation) <- c("seul","couple","famille","autre")
diagcroix(situation,col=c("orange","darkgreen","black","tan"))
detach(NUTRIAGE)

Croisement de deux variables quantitatives

Description

Cette fonction permet d'enjoliver le graphique fournit par la fonction plot() dans le cadre du croisement de deux variables quantitatives

Usage

flashy.plot(x,y,facteur, family = "HersheyScript",xlab="",ylab="")

Arguments

x

y

facteur

family

xlab

ylab

Value

Un graphique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 9 (Statistique descriptive) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(NUTRIAGE)
attach(NUTRIAGE)
sexe <- as.factor(sexe)
levels(sexe) <- c("Homme","Femme")
flashy.plot(poids,taille,sexe,xlab="Taille",ylab="Poids")
detach(NUTRIAGE)

La fonction fleches

Description

Usage

fleches(x = TRUE, y = TRUE)

Arguments

x

y

Value

No return value, called for side effects. The function adds arrows to the current plot.

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 9 (Statistique descriptive) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

curve(cos(x),xlim=c(-10,10))
fleches()

Diagramme en tuyaux d'orgues

Description

Diagramme en tuyaux d'orgues

Usage

tuyauxorgue(x, col, titre, pareto = FALSE, freq.cumul = FALSE, family = "HersheyScript")

Arguments

x

variable qualitative

col

titre

chaine de caractÃ¨res pour le titre du graphique

pareto

freq.cumul

family

Value

Un graphique

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <benoit.liquet@isped.u-bordeaux2.fr>

References

Chapitre 9 (Statistique descriptive) du livre: Le logiciel R, Maitriser le langage, Effectuer des analyses statistiques

Examples

data(NUTRIAGE)
attach(NUTRIAGE)
situation <- as.factor(situation)
levels(situation) <- c("seul","couple","famille","autre")
col <- c("gray","orangered","lightgoldenrodyellow","red")
tuyauxorgue(situation,col)
detach(NUTRIAGE)

Writing a value at some memory address

Description

Writing a value at some memory address

Usage

writeaddr(addr, newval, type = "integer",
size = 4, length = 1, out.of.bounds = FALSE)

Arguments

addr

Integer value. Address in memory.

newval

New value to write at this address.

type

type

size

size

length

length

out.of.bounds

TRUE or FALSE

Value

Nothing is returned.

Author(s)

Lafaye de Micheaux Pierre <lafaye@unsw.edu.au>, Remy Drouilhet <Remy.Drouilhet@upmf-grenoble.fr>, Liquet Benoit <b.liquet@uq.edu.au>

References

Chapter 9 (Managing Sessions) from the book: The R Software, Fundamentals of Programming and Statistical Analysis

Examples


x <- c(8L,9L)
addr <- getaddr(x) # Gets the address of the first
                            # box of the 64-box block where x
                            # is stored.
addr
writeaddr(addr,6L) # Write the integer 6 at this address.
x
writeaddr(addr+4L,7L) # An integer is coded over 4 bytes,
                      # hence increment the address by 4 to
                      # get to x[2].
x
x <- c(12.8,4.5)
x
addr <- getaddr(x) # Get the address of the first box
                            # of the 128-box block where x is
                            # stored.
writeaddr(addr,6.2)
x
writeaddr(addr+8L,7.1) # A double is coded over 8 bytes.
x

Package {LeLogicielR}

Indice de masse corporelle chez les enfants

Description

Usage

Format

Author(s)

Source

Examples

Etude sur l'infarctus du myocarde

Description

Usage

Format

Details

Author(s)

Source

Examples

Epaisseur de l'intima-media

Description

Usage

Format

Author(s)

Source

Examples

Package illustrant le livre: Le Logiciel R

Description

Details

Author(s)

References

Alimentation chez des personnes agees

Description

Usage

Format

Author(s)

Source

Examples

Poids de naissance

Description

Usage

Format

Author(s)

Source

Examples

Address of vector

Description

Usage

Arguments

Value

Author(s)

References

Examples

Diagramme circulaire

Description

Usage

Arguments

Value

Author(s)

References

See Also

Examples

Test du coefficient de correlation

Description

Usage

Arguments

Value

Author(s)

References

See Also

Examples

Comparaison de deux coefficients de correlation

Description

Usage

Arguments

Value

Author(s)

References

See Also

Examples

Diagramme en croix

Description

Usage